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genome_annotation

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genome_annotation [2018/08/20 15:26]
hyjeong [실행 방법]
genome_annotation [2018/08/20 15:26] (current)
hyjeong [실행 방법]
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 ==== 실행 방법 ==== ==== 실행 방법 ====
 Prokka GitHub 사이트의 [[https://​github.com/​tseemann/​prokka#​invoking-prokka|Invoking Prokka]] 항목을 참조하라. Prokka GitHub 사이트의 [[https://​github.com/​tseemann/​prokka#​invoking-prokka|Invoking Prokka]] 항목을 참조하라.
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   $ prokka --kingdom Bacteria --outdir prokka_180820 --genus Escherichia --locustag LCV --rfam --cpus 24 pilon.fasta   $ prokka --kingdom Bacteria --outdir prokka_180820 --genus Escherichia --locustag LCV --rfam --cpus 24 pilon.fasta
  
 Locus tag을 지정하지 않으면 --outdir로 지정된 디렉토리 안에 같은 이름을 접두사로 하는 파일들이 생긴다. Locus tag을 지정하지 않으면 --outdir로 지정된 디렉토리 안에 같은 이름을 접두사로 하는 파일들이 생긴다.
genome_annotation.txt · Last modified: 2018/08/20 15:26 by hyjeong