User Tools

Site Tools


metaphyler_example

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

metaphyler_example [2016/11/29 15:55] (current)
hyjeong created
Line 1: Line 1:
 +====== MetaPhyler .family.tab file example ======
 +
 +  @family @% abundance ​   @depth of coverage ​     @number of reads
 +  Chroococcales{order} ​   95.41   ​37.9 ​   4243
 +  Comamonadaceae ​ 1.27    0.5     134
 +  Rhizobiaceae ​   0.81    0.32    47
 +  Burkholderiales{order} ​ 0.69    0.27    76
 +  Caulobacteraceae ​       0.34    0.13    24
 +  Alphaproteobacteria{class} ​     0.27    0.1     25
 +  Proteobacteria{phylum} ​ 0.25    0.1     24
 +  Sphingomonadaceae ​      ​0.21 ​   0.08    15
 +  Betaproteobacteria{class} ​      ​0.18 ​   0.07    21
 +  Sphingomonadales{order} 0.13    0.05    10
 +  Rhodobacteraceae ​       0.1     ​0.04 ​   13
 +  Rhizobiales{order} ​     0.07    0.02    6
 +  Phyllobacteriaceae ​     0.05    0.02    5
 +  Deinococci{class} ​      ​0.04 ​   0.01    2
 +  Microbacteriaceae ​      ​0.02 ​   0       1
 +  Erythrobacteraceae ​     0.02    0       2
 +  Rhodobacterales{order} ​ 0.01    0       3
 +  Actinomycetales{order} ​ 0.01    0       1
 +  Nocardiaceae ​   0.01    0       1
 +  Rhodospirillaceae ​      ​0.01 ​   0       1
 +  Rhodocyclaceae ​ 0       ​0 ​      1
 +
  
metaphyler_example.txt ยท Last modified: 2016/11/29 15:55 by hyjeong