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to_be_renamed

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hyjeong [Roary]
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hyjeong [Roary]
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 === Strain-specific gene 찾기 === === Strain-specific gene 찾기 ===
-R에서 gene_presence_absence.Rtab과 gene_presence_absence.csv 두 파일을 다루면 된다. 다음의 사례에서는 Lb_1-46 균주에서 특이적인 유전자의 id를 추출하는 사례를 보여준다. Lb_1-46은 데이터프레임으로 읽어들이면 Lb_1.46으로 바뀌는 것에 유의해라. 구글링을 잘 하면 이를 원래 이름 그대로 유지하는 방법이 있다.+R에서 gene_presence_absence.Rtab과 gene_presence_absence.csv 두 파일을 다루면 된다. 다음의 사례에서는 Lb_1-46 균주에서 특이적인 유전자의 id를 추출하는 사례를 보여준다. Lb_1-46은 데이터프레임으로 읽어들이면 Lb_1.46으로 바뀌는 것에 유의해라. 구글링을 잘 하면 이를 원래 이름 그대로 유지하는 방법이 있다([[https://​blog.genoglobe.com/​2018/​12/​r-readtable.html|하루에 한 R 관련글]]).
   > dat = read.table("​gene_presence_absence.Rtab",​sep="​\t",​header=T,​row.names=1) ​   > dat = read.table("​gene_presence_absence.Rtab",​sep="​\t",​header=T,​row.names=1) ​
   > dat$Lb_1.46   > dat$Lb_1.46
to_be_renamed.txt · Last modified: 2019/06/27 11:24 by hyjeong