User Tools

Site Tools


metaphyler_example

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

metaphyler_example [2016/11/29 15:55] (current)
hyjeong created
Line 1: Line 1:
 +====== MetaPhyler .family.tab file example ======
 +
 +  @family @% abundance    @depth of coverage      @number of reads
 +  Chroococcales{order}    95.41   37.9    4243
 +  Comamonadaceae  1.27    0.5     134
 +  Rhizobiaceae    0.81    0.32    47
 +  Burkholderiales{order}  0.69    0.27    76
 +  Caulobacteraceae        0.34    0.13    24
 +  Alphaproteobacteria{class}      0.27    0.1     25
 +  Proteobacteria{phylum}  0.25    0.1     24
 +  Sphingomonadaceae       0.21    0.08    15
 +  Betaproteobacteria{class}       0.18    0.07    21
 +  Sphingomonadales{order} 0.13    0.05    10
 +  Rhodobacteraceae        0.1     0.04    13
 +  Rhizobiales{order}      0.07    0.02    6
 +  Phyllobacteriaceae      0.05    0.02    5
 +  Deinococci{class}       0.04    0.01    2
 +  Microbacteriaceae       0.02    0       1
 +  Erythrobacteraceae      0.02    0       2
 +  Rhodobacterales{order}  0.01    0       3
 +  Actinomycetales{order}  0.01    0       1
 +  Nocardiaceae    0.01    0       1
 +  Rhodospirillaceae       0.01    0       1
 +  Rhodocyclaceae  0             1
 +
  
metaphyler_example.txt ยท Last modified: 2016/11/29 15:55 by hyjeong